新賽季的歐協聯賽制於北京時間8月30日晚上8點30分進行了抽簽儀式，確定了36支參賽球隊的對手。根據賽事規定，這些球隊被分為六個檔次。

新賽季的歐協聯將采用與歐冠和歐聯相同的賽制，共有36支俱樂部參加聯賽階段（之前是小組賽階段）。相比以往的32支球隊，這次多了4支球隊有機會參與歐協聯。但與歐冠和歐聯各有八場比賽和八支球隊不同，歐協聯每支球隊將與六支不同球隊進行六場比賽。

聯賽階段的積分制度與常規賽類似，勝一場得三分，平一場得一分。所有36支球隊一起排名，每支球隊與六支不同的球隊進行比賽，其中三場在主場，三場在客場，總共進行六場比賽。排名前八名的球隊進入1/8決賽，排名第9至24名的球隊將抽簽進行兩回合的附加賽，以決出剩下的八個1/8決賽名額，排名第25至36名的球隊被淘汰。

排名第9至16的球隊作為種子隊，將面對排名第17至24的球隊進行兩回合比賽。種子隊將“先客後主”，兩回合勝者晉級1/8決賽。

從16強開始，將繼續采用現有的淘汰賽制，最後的決賽將在波蘭弗羅茨瓦夫市立球場進行。

抽簽的原則是：1）不能與同一足球協會的球隊交鋒（即“同國回避”）；2）最多只能抽到兩支來自同一足球協會的球隊。

抽簽的流程是：1）從一檔的六支球隊中手動抽取一支球隊；2）軟件自動從一至六檔中抽取一支球隊作為對手（同時遵循上述原則）；3）軟件自動決定主客場，其中來自一、二檔對手的比賽一主一客，來自三、四檔對手的比賽一主一客，來自五、六檔對手的比賽一主一客。整個流程從一檔球隊開始，一次為所有六支一檔球隊分配對手，接著二、三、四、五、六檔球隊也依次執行相同的抽簽流程，直到所有球隊都有了六個對手。歐足聯表示，軟件將在規定的抽簽原則內保證完全的隨機性，同時確保所有隊伍的抽簽順利完成。

抽簽結束後，所有球隊將得知自己的六個對手，但具體的賽程、比賽日期和開球時間將會在之後確定，以避免與歐冠和歐聯的比賽衝突。

以下是2024/25賽季歐協聯36強的分檔情況：